洪武二十四年(1391)八月，朱標奉命巡視陜西。此次出行，他肩負著兩項使命，一是核實二弟朱樉的諸多不法行為是否屬實；二是考察關中地區是否適宜建都。
年初，秦王朱樉在封國內的斑斑劣跡被人告發，大致如下：
母喪期間，毫無一絲的憂傷之色；偏信側妃鄧氏(寧河王鄧愈之女)之言，虐待并囚禁正妻王氏(元朝河南王王保保之妹)；公然強搶民婦，縱欲無度；發明種種酷刑，虐殺宮人。
元璋震怒，感慨道：“古所未有，罪不容誅！”
另外一個就是建都問題。此前，元璋已經欽定應天府為南京，開封府為北京，故鄉濠州為中都。然而，他似乎對于以上三地都不太滿意，仍然在考慮著更好的立都之處。胡子祺上書闡述了關中地區最為適宜建都的幾條理由。他覺得很有道理，于是派朱標赴關中考察山川地貌和風土人情，轉達最高領袖慰問三秦百姓的圣意。
關中之行，倒算順利，可死神卻已向朱標招手。
回京不久，朱標得知父皇要將罪名屬實的二弟朱樉處以極刑，遂奔赴宮中求情。尚未步入大殿，朱標就高聲喊道：
“不要殺啊，皇帝爸爸，求您放了二弟。”
元璋鄭重地說道：“今天朕要替天行道！”
朱標跪求：“皇帝爸爸，手下留情啊！試問人誰無過，他總算是我的弟弟，弟弟有錯，做兄長的也有責任，求皇帝爸爸放他一條生路吧！”
元璋聲色俱厲：“朕不消滅他，無法向全國人民交代。”
朱標嗚咽：“兒臣不會使您為難的，請皇帝爸爸跟全國人民說一聲，兒臣愿意一命抵一命。”
元璋大驚失色：“啊？”
朱標哭泣道：“正所謂，吾不入地獄，誰入地獄，求爸爸您體諒。我這樣做，無非是想感化二弟，以彰顯吾皇慈悲的偉大公正形象啊！”
元璋斂容：“善哉，善哉，朱樉，希望你有一天能夠領悟到你大哥這種舍生取義的精神！”
經過朱標的苦苦哀求，元璋終于人性大發，放過了朱樉，準許其返回藩國。二弟得救了，朱標卻病倒了。
由于他長期生活在魔鬼父親為他營造的壓抑而恐懼的環境當中，身心健康受到極大的摧殘。從西安回來后，旅途的勞頓，外加精神的刺激，更由于長期的高度緊張、驚恐和郁悶得不到排解，終于導致了此次疾病的總爆發。
養病期間，心憂社稷的朱標還將考察團繪制的陜西地圖呈上，并多次匯報出行期間的見聞，以及對于定都的看法。可無情的病魔終究吞噬了他的生命。
次年四月，在與病魔頑強抗爭了N天之后，朱標的病情突然惡化，最終醫治無效，逝世于南京。滿朝文武和全國人民無不為失去這位好太子而感到深切悲痛。朱標的英年早逝，對于偉大領袖朱元璋，對于朝野上下，對于大明朝未竟的各項建設事業，都是巨大的損失。他尚未嘗到做皇帝的滋味，便匆匆走完了他尊貴而郁悶的一生，享年三十七歲。悲哀，實在是悲哀！
二十多年的悉心培養付之東流，白發人送了黑發人，怎能不令老年喪子的元璋悲痛欲絕。朱標死去多日后，思子心切的老皇帝依舊穿著喪衣，遲遲不忍脫去。
八月，朱標被葬于孝陵東側，謚號“懿文”。原來，文章開頭部分提到的那座陵墓的主人就是這位可憐的懿文太子。（中新網）