汽車空調系統在使用過程中，空氣會在鼓風機、制冷系統蒸發箱、暖風系統的小水箱以及風道中流動。只要打開空調系統鼓風機或將進氣模式選擇在室內循環，不管是否使用制冷裝置，空氣都將進入上述系統。日久天長，上述裝置的表面積累許多塵埃、水分、細菌及其他污垢物，并會對人體呼吸系統及皮膚造成損害和過敏反應，直接影響乘員的健康，并且空調系統本身還會出現制冷效果差及出風量小等故障。
一般情況下每5000公里或3個月對空調濾清器進行一次清潔，每20000公里或12個月更換空調濾清器。這樣就保證您可以享受到清爽干凈的汽車室內環境，確保您的身體健康。
怎樣使用
1．先放熱氣再開空調。若車在烈日下停放時間較長，車輛啟動后不要立刻使用空調。先把所有車窗都打開，啟動外循環，把熱氣排出去，等車廂內溫度下降后，再關閉車窗，開啟空調。不應頻繁開啟和關閉空調，以防損壞空調系統。
2．車內開空調時，司機不要在車內吸煙。若吸煙，請將空調的通風控制調到“外循環”位置。
3．停車后使用空調時間不能過長。有的車主為涼快，關緊車門窗，打開空調在車里休息，這樣極易導致車內一氧化碳濃度升高而中毒。
4．在空氣進氣口附近不能堆放物品，以防進氣口被堵，致使空調系統空氣流通受阻。
5．在到達目的地（停車）之前幾分鐘關掉冷氣，稍后開啟自然風，在停車前使空調管道內的溫度回升，消除與外界的溫差，從而保持空調系統的相對干燥。避免因潮濕造成大量霉菌的繁殖。
需要注意
一般1.3升以上排量的轎車，空調效果基本都可以的，但一些1升或1升以下的微型車(論壇)，因發動機功率小而導致空調效果不理想，甚至開空調走一段路就會發生水沸現象，尤其在炎熱的暑天。因此夏天空調使用要注意的事情有以下兩點∶
一、如果發動機因開空調增大負荷導致水溫過高，要暫停使用空調，至水溫正常為止。
二、要避免停車時以怠速工況在夏日高溫下長時間使用空調，由于空調無法得到有效冷卻容易因系統溫度和壓力過高而損壞。長時間停車開空調對乘員的生命安全也有威脅，因為汽車排出的廢氣有可能被吸入車廂使人中毒。